Poplatníkem poplatku za znečišťování ovzduší je provozovatel stacionárního zdroje uvedeného v příloze č. 2 k zákonu č. 201/2012 Sb., o ochraně ovzduší, v platném znění (dále jen „zákon“). Předmětem poplatku za znečišťování jsou znečišťující látky (TZL, NO_x, SO₂, VOC), které jsou vypouštěné stacionárním zdrojem nebo zdroji umístěnými v provozovně, a pro které má provozovatel povinnost zjišťovat úroveň znečišťování. Správu poplatku za znečišťování ovzduší vykonává místně příslušný krajský úřad (podle umístění jednotlivých stacionárních zdrojů). Správu placení tohoto poplatku vykonávají místně příslušné celní úřady.

Poplatník podává poplatkové přiznání do 31. března roku následujícího po skončení poplatkového období (kalendářního roku) krajskému úřadu prostřednictvím Integrovaného systému plnění ohlašovacích povinností v oblasti životního prostředí (ISPOP). Poplatkové přiznání se podává pouze elektronicky na formuláři „F_OVZ_POPL“. Souběžně s poplatkovým přiznáním provozovatel podává souhrnnou provozní evidenci na formuláři „F_OVZ_SPE“. Údaje uvedené v souhrnné provozní evidenci by měly odpovídat údajům uvedeným v poplatkovém přiznání. Do přílohy formuláře „F_OVZ_POPL“ je třeba elektronicky přiložit způsob výpočtu množství zpoplatněných znečišťujících látek a výpočet poplatku. Dále by mělo poplatkové přiznání obsahovat protokoly o autorizovaném měření emisí či výstup z kontinuálního měření emisí. V případě, že nelze údaje přiložit k poplatkovému přiznání, lze je přiložit k souhrnné provozní evidenci či individuálně zaslat do datové schránky Krajského úřadu Pardubického kraje či dle domluvy odeslat na e-mail správce daně. Poplatkové přiznání není povinen podat poplatník, u něhož celková výše poplatků za provozovnu za poplatkové období činí méně než 50 000 Kč. Hranice 50 000 Kč pro nutnost podat poplatkové přiznání se vztahuje i na provozovny, které před uplatněním postupů snižujících výši poplatku dosahovaly této částky.

Krajský úřad na základě poplatkového přiznání vyměří poplatek za znečišťování ovzduší, který je splatný ve lhůtě do 30 dnů ode dne doručení platebního výměru na účet místně příslušného Celního úřadu (viz internetové stránky Celní správy).

Problematika poplatků za znečišťování ovzduší je blíže definována v § 15 zákona a příloze č. 9 k zákonu. Na správu poplatků se vztahuje zákona č. 280/2009 Sb., daňový řád, ve znění pozdějších předpisů.

Informace k aktuálnímu poplatkovému období lze naleznout na internetových stránkách Ministerstva životního prostředí, ČHMÚ (sekce ovzduší – souhrnná evidence) a ISPOP.